По результатам работы на стационаре за 2000-2012 гг. опубликовано 11 глав в монографиях, 43 статьи в зарубежных журналах и 34 статьи в российских журналах.

ГЛАВЫ В МОНОГРАФИЯХ

Природный комплекс и биоразнообразие участка «Озеро Шира» заповедника Хакасский / коллектив авторов. Под ред. В.В. Непомнящего. – Абакан: Хакасское книжное издательство, 2011.

• Рогозин Д.Ю. Стратификация озера Шира. с. 28-40

• Рогозин Д.Ю. Дегерменджи А.Г. Микроорганизмы и процессы круговорота серы в озере Шира. с. 67-101

• Ануфриева Т.Н., Дроботов А.В., Задереев Е.С., Толомеев А.П. Зоопланктон озера Шира. с. 287 - 303

• Бархатов Ю.в., Хромечек Е.Б. Инфузории озера Шира. с. 304-309

• Рогозин Д.Ю., Пуляевская М.В., Зуев И.В. Ихиофауна озера Шира. с. 318-327

Роль микроорганизмов в функционировании живых систем: фундаментальные проблемы и биоинженерные приложения (под редакцией В.В. Власова, А.Г. Дегерменджи, Н.А. Колчанова, В.Н. Пармона и В.Е. Репина). Новосибирск: Изд-во СО РАН. 2010.

• Дегерменджи А.Г., Рогозин Д.Ю. Общее описание меромиктических озер Юга Сибири. Стр. 102-104.

• Прокопкин И.Г., Дегерменджи А.Г., Рогозин Д.Ю. Новая одномерная вертикальная модель меромиктического соленого озера Шира (Россия, Хакасия): принципы, уравнения, модельные. Стр. 150-162.

• Рогозин Д.Ю., Дегерменджи А.Г. Скорости микробных процессов цикла серы и углерода в озерах Шира и Шу¬нет. Стр. 119-125.

• Рогозин Д.Ю., Прокопкин И.Г., Дегерменджи А.Г. Экологический прогноз динамики серного цикла в озерах Шира и Шунет с помощью математических моделей. Стр. 163-167.

• Рогозин Д.Ю., Трусова М.Ю., Дегерменджи А.Г. Структура и динамика микробного сообщества серного цикла в озерах Шира и Шунет. Стр. 104-118.

Биоразнообразие и динамика экосистем: информационные технологии и моделирование. Интеграционные проекты СО РАН, Изд-во СО РАН, Новосибирск, 2006

• Рогозин Д.Ю., Дегерменджи А.Г. Меромиктические озера как пример экосистем, в которых пространственная гетерогенность в значительной степени определяет биоразнообразие. Стр. 436-441.

СТАТЬИ В ЗАРУБЕЖНЫХ ЖУРНАЛАХ

1. Adamovich V.V., Zotina T.A., Degermendzhy A.G. Interaction coefficients in the Shira Lake algal-bacterial community // Aquatic Ecology. 2002. V. 36, No. 2. Р . 261-270.

2. Belolipetskii P.V., Belolipetskii V.M., Genova S.N., Mooij W.M. Numerical modeling of vertical stratification of Lake Shira in summer // Aquatic Ecology, 2010. 44. P. 561-570.

3. Boyandin A.N., Lobova T.I., Popova L.Yu., Pechurkin N.S. S urvival and alteration of the plasmid-containing microorganism Escherichia coli Z905/p phl 7introduced into manmade closed aquatic microcosms // Adv. Space Res. 2003. V. 31, №7. P. 1763-1768.

4. Degermendzhi A. (2010) Coexistence of microbial populations and autostabilization of regulating factors in continuous culture: theory and experiments. Aquatic Ecology Volume 44, Number 3, 541-560

5. Degermendzhy A.G., Belolipetsky V.M., Zotina T.A., Gulati R. Formation of the vertical heterogeneity in the Shira Lake ecosystem: the biological mechanisms and mathematical model // Aquatic Ecology. 2002. V. 36, No. 2. Р . 271-297.

6. Degermendzhy A.G., Gulati R.D. Understanding the mechanisms of blooming of phytoplankton in Lake Shira , a saline lake in Siberia (the Republic of Khakasia ) // Aquatic Ecology. 2002. V. 36, No. 2. P. 331-340.

7. Degermendzhy AG, Zadereev YS, Rogozin DY, Prokopkin IG, Barkhatov YV, Tolomeev AP, Khromechek EB, Janse JP, Mooij WM and Gulati RD (2010) Vertical stratification of physical, chemical and biological components in two saline lakes Shira and Shunet (South Siberia, Russia). Aquatic Ecology 44(3): 619-632.

8. Gaevsky N.A., Zotina T.A., Gorbaneva T.B. Vertical structure and photosynthetic activity of Shira Lake phytoplankton // Aquatic Ecology. 2002. V. 36, No. 2. Р .165-178.

9. Genova SN, Belolipetskii VM, Rogozin DY, Degermendzhy AG and Mooij WM (2010) A one-dimensional model of vertical stratification of Lake Shira focused on winter conditions and ice cover. Aquatic Ecology 44 (3): 571-584.

10. Gladyshev M.I., Emelianova A.Y., Kalachova G.S., Zotina T.A., Gaevsky N.A., Zhilenkov M.D. Gut content analysis of Gammarus lacustris from a Siberian lake using biochemical and biophysical methods // Hydrobiologia. 2000. 431: 2-3, 155-163.

11. Kalacheva G.S., Gubanov V.G., Gribovskaya I.V., Gladchenko I.A., Zinenko G.K., Savitsky S.V. С hemical analysis of Lake Shira water (1997-2000) // Aquatic Ecology. 2002. V. 36. P. 123-141.

12. Kalacheva G.S., Zhila N.O., Volova T.G. Lipid and hydrocarbon compositions of a collection strain and a wild sample of the green microalgae Botryococcus //Aquatic Ecology. 2002. V. 36, No 2. P. 317-330.

13. Khromechek EB, Barkhatov YV, Rogozin DY (2010) Densities and distribution of flagellates and ciliates in the chemocline of saline, meromictic Lake Shunet (Siberia, Russia). Aquatic Ecology 44: 497-511.

14. Kopylov A.I., Kosolapov D.B., Degermendzhy N.N., Zotina T.A., Romanenko A.V. Phytoplankton and bacterial production and protozoan bacterivory in a stratified, brackish-water Lake Shira (Khakasia, Siberia) // Aquatic Ecology. 2002. V. 36, No. 2. Р . 205-218.

15. Kopylov A.I., Kosolapov D.B., Romanenko A.V., Degermendzhy A.G. Structure of planktonic microbial food web in a brackish stratified Siberian lake // Aquatic Ecology. 2002. V. 36, No. 2. P. 179-204.

16. Kosolapov D.B., D.Y. Rogozin, I.A. Gladchenko, A.I. Kopylov and E.E. Zakharova. Microbial Sulfate Reduction in Brackish Meromictic Steppe Lake // Aquatic Ecology, 2003, V.37, No.3, P. 215-226.

17. Kudryasheva N., Vetrova E., Kuznetsov A., Kratasyuk V. and Stom D. Bioluminescence Assays: Effects of Quinones and Phenols // Ecotoxicology and Environmental Safety. 2002. V. 53, No 3. P. 198-203.

18. Lobova T.I., Barchatov Yu.V., Popova L.Yu. Antibiotic resistance of heterotrophic bacteria in Shira lake: natural and anthropogenic impacts // Aquat. Microb. Ecol. 2002. V. 30, № 1. P. 11-18.

19. Lobova T.I., Listova L.V., Popova L.Y. Distribution of heterotrophic bacteria in Lake Shira // Microbiology 2004. 73: 1, 89-93.

20. Lobova T.I., Maksimova E.E., Popova L.Yu., Pechurkin N.S. Seasonal dynamics of multiple antibiotic resistance of Shira Lake heteretroph microflora // Aquatic Ecology. 2002. V. 36, No. 2. P. 299-307.

21. Lobova T.I., Zagrebelnyi S.N., Popova L.Y. The influence of salt concentration on the copy number of plasmid pSH1 replicating in Micrococcus sp 9 // Microbiology. 2005. 74: 3, 296-302.

22. Lobova Tatiana I., Yuriy V. Barkhatov, Olga V. Salamatina, Ludmila Yu. Popova. Heterogeneity of Heterotrophic Bacteria Dominating in Brackish Lake Shira (Republic of Khakasia, Russia) Subjected to Anthropogenic Impact // J. Water Resource and Protection, 2010, 2(5), 389-395

23. Makhutova O.N., Kalachova G.S., Gladyshev M.I. A comparison of the fatty acid composition of Gammarus lacustris and its food sources from a freshwater reservoir, Bugach, and the saline Lake Shira in Siberia, Russia // Aquatic Ecology. 2003. 37: 2, 159-167

24. Mooij Wolf M., Dennis Trolle, Erik Jeppesen, George Arhonditsis, Pavel V. Belolipetsky, Deonatus B. R. Chitamwebwa, Andrey G. Degermendzhy, Donald L. DeAngelis, Lisette N. De Senerpont Domis, Andrea S. Downing, J. Alex Elliott, Carlos Ruberto Fragoso, Ursula Gaedke, Svetlana N. Genova, Ramesh D. Gulati, Lars Hakanson, David P. Hamilton, Matthew R. Hipsey, Jochem ‘t Hoen, Stephan Hulsmann, F. Hans Los, Vardit Makler-Pick, Thomas Petzoldt, Igor G. Prokopkin, Karsten Rinke, Sebastiaan A. Schep, Koji Tominaga, Anne A. Van Dam, Egbert H. Van Nes, Scott A. Wells & Jan H. Janse, 2010. Challenges and opportunities for integrating lake ecosystem modelling approaches // Aquatic Ecology. V. 44. № 3. pp. 633-667.

25. Parnachev V.P., Degermendzhy A.G. Geographical, geological and hydrochemical distribution of saline lakes in Khakassia, Southern Siberia // Aquatiс Ecology. 2002. V. 36, No. 2. P. 107-122.

26. Prokopkin I. G., W. M. Mooij, J. H. Janse & A. G. Degermendzhy. 2010. A general one-dimensional vertical ecosystem model of Lake Shira (Russia, Khakasia): description, parametrization and analysis // Aquatic Ecology. V. 44. № 3, pp. 585-618.

27. Quesada A., Juttner F., Zotina T., Tolomeyev A., Degermendzhy A. Heterotrophic capability of a metalimnetic plankton population on saline Lake Shira (Siberia, Khakasia) // Aquatic Ecology. 2002. V. 36, No. 2. Р . 219-227.

28. Rogozin DY, Genova SV, Gulati RD and Degermendzhy AG (2010) Some generalizations on stratification and vertical mixing in meromictic Lake Shira, Russia, in the period 2002-2009. Aquatic Ecology V.44, No.3, P.485-496.

29. Rogozin DY, Zykov VV, Chernetsky MY, Degermendzhy AG and Gulati RD (2009) Effect of winter conditions on distributions of anoxic phototrophic bacteria in two meromictic lakes in Siberia, Russia. // Aquatic Ecology V.43, No.3, P. 661- 672.

30. Shevyrnogov A.P., Kartushinsky A.V. and Vysotskaya G.S. Application of satellite data for investigation of dynamic processes in inland water bodies // Aquatic Ecology. 2002. No. 2. P. 153-164.

31. Tatiana I. Lobova, Yuri V. Barkhatov, Ol’ga V. Salamatina, Lyudmila Yu. Popova Multiple antibiotic resistance of heterotrophic bacteria in the littoral zone of Lake Shira as an indicator of human impact on the ecosystem. // Microbiological Research 163 (2008) 152—160

32. Temerova T.A., Tolomeyev A.P., Degermendzhy A.G. Growth of dominant zooplankton species feeding on plankton microflora in Lake Shira // Aquatic Ecology. 2002. V. 36, No. 2. P. 235-243.

33. Tolomeev A. P., N. N. Sushchik, R. D. Gulati, O. N. Makhutova, G. S. Kalacheva and T. A. Zotina. Feeding spectra of Arctodiaptomus salinus (Calanoida, Copepoda) using fatty acid trophic markers in seston food in two salt lakes in South Siberia (Khakasia, Russia) Aquatic Ecology Volume 44, Number 3, 513-530

34. Tolomeyev A.P. Phytoplankton diet of Arctodiaptomus salinus (Copepoda, Calanoida) in Shira lake (Khakasia) // Aquatic Ecology. 2002. V. 36, No. 2. P. 229-234.

35. Tolomeyev A.P., Zadereev Ye.S. An in situ method for the investigation of vertical distributions of zooplankton in lakes: test of a two-compartment enclosure // Aquatic Ecology. 2005. 39 (2): 181-188.

36. Vetrova E.V., Kratasyuk V. А ., Kudryasheva N.S. Bioluminescent characteristics map of Shira lake water // Aquatic Ecology. 2002. V. 36, No. 2. P. 309-315. Vetrova E.V., Prochorova, E.V. Bioluminescent testing of redox active compounds. // Luminescence, 2006, V21, p. 295.

37. Vetrova E.V., Prochorova, E.V. Bioluminescent testing of redox active compounds. // Luminescence, 2006, V21, p. 295.

38. Vetrova E.V., Prochorova, E.V. Influence of inorganic sulfur compounds on bioluminescent system NAD(P)H:FMN-oxidoreductae – luciferase. // Luminescence, 2006, V21, p. 295.

39. Vetrova E.V., Prochorova, E.V. Influence of inorganic sulfur compounds on bioluminescent system NAD(P)H:FMN-oxidoreductae - luciferase. // Luminescence, 2006, V21, p. 295.

40. Yemelyanova A.Y., Temerova T.A., Degermendzhy A.G. Distribution of Gammarus lacustris Sars (Amphipoda, Gammaridae) in Lake Shira (Khakasia, Siberia) and laboratory study of its growth characteristics // Aquatic Ecology. 2002. V. 36, No. 2. P. 245-256.

41. Zadereev E.S., Tolomeyev A.P. The vertical distribution of zooplankton in brackish meromictic lake with deep-water chlorophyll maximum. // Hydrobiologia. 2007. V. 576, No. 1. P. 69-82.

42. Zadereev Egor S., Alexander P. Tolomeyev, Anton V. Drobotov, Anna Yu. Emeliyanova and Mikhail V. Gubanov. The vertical distribution and abundance of Gammarus lacustris in the pelagic zone of the meromictic lakes Shira and Shunet (Khakassia, Russia) Aquatic Ecology Volume 44, Number 3, 531-539

43. Zadereev Ye. S., Gubanov M.V. The effect of chemicals released by Gammarus lacustris on the depth distribution of Arctodiaptomus salinus in laboratory conditions // Aquatic Ecology. 2002. V. 36, No. 2. P. 257-260.

СТАТЬИ В РОССИЙСКИХ ЖУРНАЛАХ

1. Рогозин Д.Ю., Зыков В.В., Калугин И.А., Дарьин А.В., Дегерменджи А.Г. (2011) Каротиноиды фототрофных организмов в донных отложениях меромиктического озера Шира (Россия, Сибирь) как индикатор стратификации озера в прошлом. Докл. АН. - т. 439, № 2, c. 282-285

2. Rogozin DY, Pulyaevskaya MV, Zuev IV, Makhutova ON, Degermendzhi AG (2011) Growth, diet and fatty acid composition of gibel carp Carassius gibelio in Lake Shira, a brackish water body in southern Siberia. Journal of Siberian Federal University. Biology 1, (2011 4), P.86-103.

3. Жила Н.О., Прудникова С.В., Задереев Е.С., Рогозин Д.Ю. Деградация пленок из полигидроксиалканоатов в солоноватоводном озере Шира // Журнал Сибирского федерального университета. 2012. Т. 5, № 2. С. 210-215.

4. Задереев Е. С., Толомеев А.П., Дроботов А.В. Несинхронные вертикальные миграции зоопланктона в стратифицированных озерах // Сибирский экологический журнал. 2012. № 4. С. 597-605.

5. Зыков В.В., Рогозин Д.Ю., Калугин И.А., Дарьин А.В., Дегерменджи А.Г.. Каротиноиды в донных отложениях озера Шира как палеоиндикатор для реконструкции состояний озера (Россия, Хакассия) // Сибирский экологический журнал, 4 (2012) с.585-595.

6. Компаниец Л.А., Якубайлик Т.В., Володько О.С. Анализ характеристик озера Шира на основе натурных данных // Вестник Бурятского государственного университета. Математика. Информатика. Вып. 9, 2012. С. 167-176.

7. Рогозин Д.Ю., Зыков В.В., Дегерменджи А.Г. Экология пурпурных серных бактерий в сильно стратифицированном меромиктическом озере Шунет (Сибирь, Хакасия) в период 2002-2009 гг. // Микробиология, 2012, Т. 81, № 6, c. 786-795.

8. Третьяков Г.А., Калугин И.А., Дарьин А.В., Рогозин Д.Ю., Дегерменджи А.Г. Физико-химические условия сезонного осаждения карбонатов в озере Шира (Хакасия). // Докл. АН. 2012 т. 446, № 2, c. 197-200.

9. Belolipetskii V.M., Belolipetskii P.V. Numerical algorithm for studying wind flows two-dimensional in the in vertical plane in stratified reservoirs // Russ. J. Numer. Anal. Math. Modelling, 2010. Vol. 25, No. 1. P. 1-14.

10. Rogozin DY and Degermendzhy AG (2008) Hydraulically-operated thin-layer sampler for sampling heterogeneous water columns. // Journal of Siberian Federal University, V.1, No 2, P.111-117.

11. Volova T.G., Kalacheva G.S., Zhila N.O. Specificity of lipid composition in two Botryococcus strains, the producers of liquid hydrocarbons // Russian Journal Of Plant Physiology. 2003. 50: 5, 627-633.

12. Ануфриева Т.Н. Таксономическая структура зоопланктона минерализованных озер Хакасии // Вестник Красноярского гос. ун-та, Т.5, 2006. - С. 69-73.

13. Белолипецкий В.М. Численное моделирование ветровых течений в стратифицированных водоемах. // Водные ресурсы. 2001. Т. 28. №1. С. 133-137.

14. Белолипецкий В.М., Белолипецкий П.В. Численное моделирование ветровых течений в стратифицированных водоемах методом расщепления. Гидростатическое приближение // Вычислительные технологии. 2006. Т.11, №5. С. 21-31.

15. Белолипецкий В.М., Белолипецкий П.В. Численное моделирование ветровых течений в стратифицированных водоемах методом расщепления. Гидростатическое приближение // Вычислительные технологии. 2006. Т.11, №5. С. 21-31.

16. Белолипецкий В.М., Генова С.Н. Численное моделирование годовой динамики вертикальной структуры соленого озера // Вычислительные технологии. 2008. Т.9. №4. С. 34-43.

17. Белолипецкий В.М., Генова С.Н. Численные расчеты вертикальных распределений температуры и солености воды в озере Шира // Вычислительные технологии. 2008. Т.13. Вестник КазНУ им. Аль-Фараби, сер. Математика, механика, информатика №3(58).-Совместный выпуск. Ч.1. С.261-266.

18. Белолипецкий В.М., Генова С.Н., Наумченко О.А. Одномерная модель теплового и солевого режимов стратифицированного озера. // Вычислительные технологии. 2003. Т.8. Региональный вестник Востока. 2003. №3. Совместный выпуск. Ч.1. С. 131-138.

19. Бояндин А.Н., Попова Л.Ю. Зависимое от минеральных солей ингибирование свечения люминесцентного микроорганизма Escherichia coli Z9051 // Биофизика. 2001. Т. 46, № 2. С. 251-255.

20. Гаврилова Л.В., Компаниец Л.А., Якубайлик Т.В. Аналитическое решение одной модели движения однородной жидкости в мелком водоеме (2 D и 3 D случай). // Вычислительные технологии. 2003. Т.8. Региональный вестник Востока. 2003. №3. Совместный выпуск. Ч.4. С. 125-131.

21. Генова С.Н., Лукавенко П.Н. Двумерная в вертикальной плоскости модель гидротермического режима непроточного водоема // Вычислительные технологии, 2002, т.7, №4, с. 9-17.

22. Губанов М.В., Задереев Е.С., Дегерменджи А.Г. Исследование химических коммуникаций между двумя доминантными представителями биоты озера Шира Gammarus lacustris Sars (Crustacea: Amphipoda) и Arctodiaptomus salinus Daday (Crustacea: Copepoda) // Доклады академии наук. 2010. 434, 318–321

23. Емельянова А.Ю., Темерова Т.А., Дегерменджи А.Г. Экспериментальное изучение питания и роста бокоплава Gammarus Lacustris Sars (AMPHIPODA, GAMMARIDAE) из оз. Шира (Хакасия) // Биол. вн. вод. -2000. -№ 4. - Стр. 86-93.

24. Заворуев В.В., Зотина Т.А. Доминирование Lyngbya contorta Lemm. и фотосинтетическая активность фитопланктона в солоноватом меромиктическом озере Шира. // Гидробиологический журнал, 2002, том 38, № 2. - С. 7-17.

25. Зотина Т.А. Вертикальное распределение фитопланктона соленого озера Шира. // Гидробиологический журнал, 2000, т.36, №1.- С. 38-46.

26. Каллистова, А.Ю., М.В. Кевбрина, Н.В. Пименов, И.И. Русанов, Д.Ю. Рогозин, Б. Верли, А.Н. Ножевникова. Сульфатредукция и метаногенез в меромиктических озерах Шира и Шунет (Хакасия) // Микробиология, 2006, т. 75, № 6. стр. 828 -835.

27. Каллистова, А.Ю., М.В. Кевбрина, Н.В. Пименов, И.И. Русанов, Д.Ю. Рогозин, Б. Верли, А.Н. Ножевникова. Сульфатредукция и метаногенез в меромиктических озерах Шира и Шунет (Хакасия) // Микробиология, 2006, т. 75, № 6. стр. 828 -835.

28. Лунина О.Н., Брянцева И.А., Акимов В.Н, Русанов И.И., Рогозин Д.Ю., Баринова Е.А., Пименов Н.В. Сезонные изменения структуры сообщества аноксигенных фототрофных бактерий озера Шунет (Хакасия) // Микробиология. 2007. Т. 76, № 3. С. 416-428.

29. Лунина О.Н., Брянцева И.А., Акимов В.Н., Русанов И.И., Баринова Е.А., Лысенко А.М., Рогозин Д.Ю., Пименов Н.В. Сообщество аноксигенных фототрофных бактерий озера Шира (Хакасия). // Микробиология. 2007. Т. 76, № 4. С. 533-544.

30. Пименов Н.В., Русанов И.И., Карначук О.Н., Рогозин Д.Ю., Брянцева И.А., Лунина О.Н., Юсупов С.К., Парначев В.В., Иванов М.В. Микробные процессы циклов углерода и серы в озере Шира (Хакасия) // Микробиология, 2003, v .72, № 2, c . 259-267.

31. Рогозин Д.Ю., Трусова М.Ю., Хромечек Е.Б., Дегерменджи (2010) Микробное сообщество хемоклина меромиктического озера Шунет (Хакасия, Россия) в период летней стратификации. Микробиология, Т. 79, № 2, 277-285

32. Толомеев А.П., Задереев Е.С. Действие солнечной радиации на вертикальные миграции Arctodiaptomus salinus и Brachionus plicatilis в озере Шира. // Биология внутренних вод. 2003. №2. С. 74-79.

33. Толомеев А.П., Задереев Е.С., Дегерменджи А.Г. Тонкое стратифицированное распределение Gammarus lacustris sars (Crustacea: Amphipoda) в пелагиали меромиктического озера Шира (Россия, Хакасия). 2006. Доклады академии наук. Т. 412, № 4: 549-552

34. Шатилина Ж.М., Губанов М.В., Задереев Е.С., Павличенко В.В., Аксёнов-Грибанов Д.В., Сапожникова Е.А., Протопопова М.В., Бедулина Д.С., Тимофеев М.А. Сравнительное исследование клеточных механизмов термоустойчивости у представителей популяций Gammarus lacustris Sars, населяющих солёное озеро Шира (республика Хакасия) и пресный водоем Прибайкалья // Доклады академии наук, 2010, том 434, № 6, с. 846–849